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go語言的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)整合包,gorm 數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu) 生成

Golang常用包有哪些

⑴ Go Kit

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它本身不是一個框架,而是一套微服務(wù)工具集,可以用于解決分布式系統(tǒng)開發(fā)中的大多數(shù)常見問題,所以使用者可以專注于你的業(yè)務(wù)邏輯中。

⑵ Gingko

是一個Go測試框架,目的是幫助我們使用行為驅(qū)動開發(fā)風(fēng)格高效地編寫富有表現(xiàn)力和全面的測試,它有著非常良好的幫助文檔,任何人都可以輕松地在項(xiàng)目中集成使用它。

⑶ NSQ

實(shí)時(shí)分布式消息傳遞平臺,提供高可用性和可靠的消息傳遞保證,可以水平擴(kuò)展,支持負(fù)載均衡,安裝部署非常方便。

⑷ Goose

Golang中最佳的數(shù)據(jù)庫遷移包,通過創(chuàng)建增量SQL更改和Go函數(shù)來管理數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu),在Go1.16版本以上,還支持了嵌入式sql遷移。

⑸ GORM

是一個功能齊全的Golang對象關(guān)系映射庫,是一種開發(fā)人員友好的工具,用于在不兼容的類型系統(tǒng)之間轉(zhuǎn)換數(shù)據(jù),專門設(shè)計(jì)用于在類型系統(tǒng)之間切換時(shí)最大限度地減少重寫代碼。

⑹ Authboss

一個模塊化的身份驗(yàn)證包,使用它你可以快速地在項(xiàng)目中進(jìn)行身份驗(yàn)證管理。它有幾個常見的身份驗(yàn)證和授權(quán)模塊供開發(fā)人員選擇。

⑺ cli

是一個簡單快捷的命令行管理包,用于為Go語言構(gòu)建命令行應(yīng)用程序,允許開發(fā)人員開發(fā)自己的富有表現(xiàn)力的命令行應(yīng)用程序,用于創(chuàng)建標(biāo)志、bash完成例程并生成幫助文本。

⑻ Vegeta

是一個用于HTTP負(fù)載測試的工具包,這個多功能工具專為測試具有恒定請求率的HTTP服務(wù)而設(shè)計(jì)。它可以有效地分析程序中的潛在問題,是一個始終貫穿以提高整體性能為目的的包。

Go數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)篇

1、基本數(shù)據(jù)類型

bool

string

int int8 int16 int32 int64

uint uint8 uint16 uint32 uint64 uintptr

byte // alias for int8

rune // alias for int32,represents a Unicode code point

float32 float64

complex64 complex128

常量定義

2、類型轉(zhuǎn)換

(1)Go語言不允許隱式類型轉(zhuǎn)換(不支持小位數(shù)類型向大位數(shù)類型轉(zhuǎn))

(2)別名和原有類型也不能進(jìn)行隱式類型轉(zhuǎn)換(type MyInt int64 = int64)

3、類型的預(yù)定義值

1.math.MaxInt64

2.math.MaxFloat64

3.math.MaxUInt32

4、指針類型

(1)不支持指針運(yùn)算

(2)string是值類型,其默認(rèn)的初始化值為空字符串,而不是nil

5、算術(shù)運(yùn)算符

+ - * / % ++ --(不支持前置++ --)

6、比較運(yùn)算符

#== != = =

(1)比較數(shù)組

相同維數(shù)且含有形同個數(shù)元素的數(shù)組才可以比較

每個元素都相同的才相等

7、位運(yùn)算符

| ^

^ (按位置零) a (^b)

1 ^ 0 1

1 ^ 1 0

0 ^ 1 0

0 ^ 0 0

8、條件與循環(huán)

(1)循環(huán)

Go 語?僅?持循環(huán)關(guān)鍵字 for

(2)條件

9、數(shù)組和切片

數(shù)組截取,索引下標(biāo)從0開始計(jì)數(shù)

a[開始索引(包含), 結(jié)束索引(不包含)]

a := [...]int{1, 2, 3, 4, 5}

a[1:2] //2

a[1:3] //2,3

a[1:len(a)] //2,3,4,5

a[1:] //2,3,4,5

a[:3] //1,2,3

切片內(nèi)部結(jié)構(gòu)

9、Map

9、字符串

Unicode UTF8

常?字符串函數(shù)

GO數(shù)據(jù)庫介紹(轉(zhuǎn)載)

類似于語義網(wǎng)絡(luò)。是為了生物界有一個統(tǒng)一的數(shù)據(jù)交流語言。 因?yàn)樵谏飳W(xué)界,存在在種種同名異義、異議同名的現(xiàn)象。為此產(chǎn)生了GO項(xiàng)目。

GO是用一套統(tǒng)一的詞匯表來描述生物學(xué)中的分子功能、生物過程和細(xì)胞成分。其思想大概過程:對于一個基因產(chǎn)品(蛋白質(zhì)或RNA),用某些詞匯來描述它是干什么的或位于細(xì)胞哪里、或者參與了哪個生物過程,而這些詞匯就是來自GO的Term。

(1)提供生物學(xué)功能(術(shù)語)的邏輯結(jié)構(gòu)及其相互之間的關(guān)系,表現(xiàn)為有向無環(huán)圖

(2)給特定的基因產(chǎn)物(蛋白質(zhì),非編碼RNA或大分子復(fù)合體,簡稱為'基因')起一個特定的名字(唯一標(biāo)識該基因)

Gene Ontology(GO)中最基本的概念是term。GO里面的每一個entry都有一個唯一的數(shù)字標(biāo)記,形如GO:nnnnnnn,還有一個term名,比如"cell", "fibroblast growth factor receptor binding",或者"signal transduction"。每個term都屬于一個ontology,總共有三個ontology,它們分別是

細(xì)胞成分:細(xì)胞的部分或其細(xì)胞外環(huán)境;

分子功能:基因產(chǎn)物在分子水平上的元素活性,例如結(jié)合或催化;

生物過程:具有確定開始和結(jié)束的分子事件的操作或集合,與綜合生活單元的功能有關(guān)

理由一:

在基因表達(dá)譜分析中,GO常用于提供基因功能分類標(biāo)簽和基因功能研究的背景知識。利用GO的知識體系和結(jié)構(gòu)特點(diǎn),旨在發(fā)掘與基因差異表達(dá)現(xiàn)象關(guān)聯(lián)的單個特征基因功能類或多個特征功能類的組合。

根據(jù)GO的知識體系,使用“功能類”(或者叫做“功能模塊”)這一概念具有以下優(yōu)點(diǎn):我們認(rèn)為,單個基因的表達(dá)情況的改變不足以反映特定功能/通路的整體變化情況。因?yàn)轭愃迫祟惿鐣慕M織結(jié)構(gòu),生物體的功能的實(shí)現(xiàn)決不僅僅是依靠一兩個基因功能的改變來實(shí)現(xiàn)的。因此過分著重單個基因表達(dá)變化,將會在后期結(jié)果處理中嚴(yán)重干擾對于結(jié)果的合理分析,導(dǎo)致偏倚性加大,而且是無法避免的。因此利用GO的結(jié)構(gòu)體系,把參與同樣功能/通路的基因進(jìn)行“功能類”層面的抽象和整合,提供比基因更高一層次的抽象結(jié)論,對理解疾病的發(fā)病機(jī)制或藥物的作用機(jī)理等更有幫助。

但是該方法也存在一定的不足,由于生物體內(nèi)部的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)可能具有“scale-free network”的特點(diǎn),個別功能重要的基因(主效基因)具有“Hub節(jié)點(diǎn)”的重要特性,它的功能改變可能對于整個網(wǎng)絡(luò)來說是至關(guān)重要的,在這點(diǎn)上,這些重要的基因又具有一定的“自私獨(dú)裁”特點(diǎn)。而“功能類”之觀點(diǎn)模糊了這種差別特性,過于強(qiáng)調(diào)“共性”,而忽視了“個性”,這也是“功能類”的一個不足之處,這就需要結(jié)合相關(guān)的生物學(xué)知識才能夠?qū)崿F(xiàn)

理由二:

GO(gene ontology)對大家而言也許會是一個相對陌生的名詞,但是它已經(jīng)成為生物信息領(lǐng)域中一個極為重要的方法和工具,并正在逐步改變著我們對 biological data的組織和理解方式,它的存在已經(jīng)大大加快了我們對所擁有的生物數(shù)據(jù)的整合和利用,我們應(yīng)該逐步學(xué)會理解和掌握這種思想和工具。

眾所周知,sequence based biology中的核心內(nèi)容即是對序列的Annotation(注釋),其中主要包含structural annotation和functional annotation,前者涉及分析sequence在genome中的locus以及exon,intron,promoter等的location,而后者則是推斷序列編碼產(chǎn)物的功能

隨著多種生物genome的相繼解碼,同時(shí)大量ESTs以及gene expression profile date的積累,使得annotation的工作量和復(fù)雜度大大增加。然而另一方面,大多數(shù)基因在不同真核生物中擁有共同的主要生物功能,通過在某些物種中獲得的基因或者蛋白質(zhì)(shared protein)的生物學(xué)信息,可以用以解釋其他物種中對應(yīng)的基因或蛋白(especially in comparative genomics)。由于這些繁復(fù)的功能信息主要是包含在積累的文獻(xiàn)之中,如何有效的提取和綜合這些信息就是我們面臨的核心困難,這也是GO所要著力解決的問題。通過建立一套具有動態(tài)形式的控制字集(controlled vocabulary),來解釋真核基因及蛋白在細(xì)胞內(nèi)所扮演的角色,并隨著生命科學(xué)研究的進(jìn)步,不斷積累和更新。一個ontology會被一個控制字集來描述并給予一定的名稱,通過制定“本體”ontologies并運(yùn)用統(tǒng)計(jì)學(xué)方法及自然語言處理技術(shù),可以實(shí)現(xiàn)知識管理的專家系統(tǒng)控制

總結(jié):

Gene Ontology(GO)包含了基因參與的生物過程,所處的細(xì)胞位置,發(fā)揮的分子功能三方面功能信息,并將概念粗細(xì)不同的功能概念組織成DAG(有向無環(huán)圖)的結(jié)構(gòu)。

Gene Ontology是一個使用有控制的詞匯表和嚴(yán)格定義的概念關(guān)系,以有向無環(huán)圖的形式統(tǒng)一表示各物種的基因功能分類體系,從而較全面地概括了基因的功能信息,糾正了傳統(tǒng)功能分類體系中常見的維度混淆問題。

在基因表達(dá)譜分析中,GO常用于提供基因功能分類標(biāo)簽和基因功能研究的背景知識。利用GO的知識體系和結(jié)構(gòu)特點(diǎn),旨在發(fā)掘與基因差異表達(dá)現(xiàn)象關(guān)聯(lián)的單個特征基因功能類或多個特征功能類的組合。

原文:

網(wǎng)頁名稱:go語言的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)整合包,gorm 數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu) 生成
當(dāng)前地址:http://chinadenli.net/article48/hscsep.html

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