這篇文章主要介紹LncRNA2Target數(shù)據(jù)庫(kù)有什么用，文中介紹的非常詳細(xì)，具有一定的參考價(jià)值，感興趣的小伙伴們一定要看完！

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lncRNA在基因表達(dá)調(diào)控中發(fā)揮重要作用，研究lncRNA調(diào)控的靶基因，有兩種研究策略，一種是通過(guò)傳統(tǒng)的實(shí)驗(yàn)手段分析lncRNA結(jié)合的蛋白質(zhì)，從而確定lncRNA與蛋白編碼基因的相互作用，常用的手段有以下幾種

1. immunoprecipitation assays

2. RNA pull down assays

3. luciferase reported assays

另外一種手段就是通過(guò)敲低或者過(guò)表達(dá)某個(gè)lncRNA, 然后檢測(cè)處理前后差異表達(dá)的基因，將差異表達(dá)的基因作為該lncRNA的靶基因, 通過(guò)芯片或者高通量測(cè)序都可以。

LncRNA2Target數(shù)據(jù)庫(kù)收集整理了已經(jīng)發(fā)表的lncRNA靶基因數(shù)據(jù)，最新版本為v2.0, 網(wǎng)址如下

http://123.59.132.21/lncrna2target/index.jsp

涵蓋了人和小鼠中的lncRNA靶基因，通過(guò)Browse菜單，可以查看對(duì)應(yīng)的結(jié)果，示意如下

通過(guò)Search菜單，可以方便的檢索數(shù)據(jù)庫(kù)，示意如下

該數(shù)據(jù)庫(kù)提供了下載功能，分別提供了傳統(tǒng)實(shí)驗(yàn)和高通量?jī)煞N手段分析的lncRNA靶基因文件，對(duì)應(yīng)以下 兩個(gè)文件

1. lncRNA_target_from_low_throughput_experiments.xlsx

2. lncRNA_target_from_high_throughput_experiments.txt

對(duì)于高通量數(shù)據(jù)，還給出了對(duì)應(yīng)的GEO編號(hào)，表達(dá)譜數(shù)據(jù)和差異分析的結(jié)果，示意如下

通過(guò)該數(shù)據(jù)庫(kù)，不僅可以查詢(xún)lncRNA的靶基因信息，還學(xué)到了研究lncRNA靶基因的思路。

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標(biāo)題名稱(chēng)：LncRNA2Target數(shù)據(jù)庫(kù)有什么用
文章鏈接：http://chinadenli.net/article38/ppdipp.html

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