PHDF5并行寫入數(shù)據(jù)是發(fā)起多個(gè)進(jìn)程,被發(fā)起進(jìn)程按照某一規(guī)則 寫入數(shù)據(jù)到指定位置。
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在本例中,有一個(gè)8(行)x 6(列)的數(shù)據(jù)集,每個(gè)進(jìn)程向數(shù)據(jù)集寫入相同數(shù)量的列。

在本例中,有兩個(gè)進(jìn)程寫入同一個(gè)數(shù)據(jù)集,每個(gè)進(jìn)程寫入數(shù)據(jù)集中的每一列。對(duì)于每個(gè)進(jìn)程,文件中的hyperlab設(shè)置如下:?
89 count[0] = 1;
90 count[1] = dimsm[1];
91 offset[0] = 0;
92 offset[1] = mpi_rank;
93 stride[0] = 1;
94 stride[1] = 2;
95 block[0] = dimsf[0];
96 block[1] = 1;維度1的步幅為2,表示沿著這個(gè)維度的每一個(gè)其他位置都將寫入。步幅為1表示將寫入一個(gè)維度上的每個(gè)位置。
對(duì)于兩個(gè)進(jìn)程,mpi_rank將是0或1。因此:
進(jìn)程0寫偶數(shù)列(0,2,4…)
進(jìn)程1寫入奇數(shù)列(1,3,5…)
塊大小允許每個(gè)進(jìn)程將一列數(shù)據(jù)寫入數(shù)據(jù)集中的每個(gè)其他位置。

下面是這個(gè)例子創(chuàng)建的HDF5文件的h5dump的輸出:
HDF5 "SDS_col.h5" {
GROUP "/" {
DATASET "IntArray" {
DATATYPE H5T_STD_I32BE
DATASPACE SIMPLE { ( 8, 6 ) / ( 8, 6 ) }
DATA {
1, 2, 10, 20, 100, 200,
1, 2, 10, 20, 100, 200,
1, 2, 10, 20, 100, 200,
1, 2, 10, 20, 100, 200,
1, 2, 10, 20, 100, 200,
1, 2, 10, 20, 100, 200,
1, 2, 10, 20, 100, 200,
1, 2, 10, 20, 100, 200
}
}
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文章來(lái)源:http://chinadenli.net/article18/cocpdp.html
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